Protein–RNA interactions for Protein: O60543

CIDEA, Cell death activator CIDE-A, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIDEAO60543 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIDEAO60543 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms