Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms