Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CREB3O43889 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CREB3O43889 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CREB3O43889 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3O43889 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3O43889 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3O43889 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3O43889 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3O43889 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3O43889 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3O43889 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3O43889 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3O43889 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3O43889 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3O43889 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3O43889 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3O43889 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3O43889 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3O43889 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3O43889 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3O43889 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3O43889 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3O43889 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3O43889 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3O43889 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3O43889 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3O43889 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3O43889 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3O43889 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3O43889 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3O43889 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3O43889 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3O43889 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3O43889 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3O43889 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3O43889 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3O43889 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3O43889 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3O43889 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3O43889 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3O43889 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3O43889 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3O43889 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3O43889 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3O43889 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3O43889 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3O43889 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3O43889 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3O43889 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3O43889 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3O43889 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3O43889 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3O43889 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3O43889 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3O43889 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3O43889 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3O43889 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3O43889 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3O43889 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3O43889 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3O43889 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3O43889 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3O43889 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3O43889 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3O43889 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3O43889 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3O43889 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3O43889 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3O43889 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3O43889 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3O43889 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3O43889 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3O43889 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3O43889 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3O43889 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3O43889 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3O43889 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3O43889 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3O43889 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3O43889 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3O43889 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3O43889 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3O43889 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3O43889 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3O43889 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3O43889 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3O43889 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3O43889 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3O43889 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3O43889 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3O43889 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3O43889 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3O43889 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3O43889 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3O43889 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3O43889 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3O43889 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3O43889 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3O43889 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3O43889 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms