Protein–RNA interactions for Protein: O43824

GTPBP6, Putative GTP-binding protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP6O43824 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTPBP6O43824 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTPBP6O43824 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTPBP6O43824 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTPBP6O43824 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTPBP6O43824 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTPBP6O43824 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTPBP6O43824 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTPBP6O43824 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTPBP6O43824 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTPBP6O43824 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTPBP6O43824 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTPBP6O43824 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTPBP6O43824 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTPBP6O43824 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTPBP6O43824 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms