Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms