Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms