Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF1O43189 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF1O43189 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF1O43189 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF1O43189 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF1O43189 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF1O43189 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF1O43189 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF1O43189 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF1O43189 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF1O43189 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF1O43189 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF1O43189 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF1O43189 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF1O43189 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF1O43189 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF1O43189 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF1O43189 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF1O43189 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF1O43189 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF1O43189 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF1O43189 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF1O43189 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF1O43189 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF1O43189 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF1O43189 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF1O43189 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF1O43189 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF1O43189 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF1O43189 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF1O43189 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF1O43189 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF1O43189 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF1O43189 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF1O43189 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF1O43189 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF1O43189 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF1O43189 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF1O43189 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF1O43189 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF1O43189 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF1O43189 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF1O43189 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF1O43189 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF1O43189 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF1O43189 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF1O43189 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF1O43189 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF1O43189 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF1O43189 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF1O43189 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF1O43189 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF1O43189 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF1O43189 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF1O43189 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF1O43189 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF1O43189 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF1O43189 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF1O43189 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF1O43189 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF1O43189 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF1O43189 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF1O43189 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PHF1O43189 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF1O43189 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF1O43189 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF1O43189 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF1O43189 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF1O43189 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF1O43189 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF1O43189 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF1O43189 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF1O43189 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF1O43189 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF1O43189 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF1O43189 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF1O43189 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF1O43189 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF1O43189 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF1O43189 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF1O43189 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF1O43189 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF1O43189 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF1O43189 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF1O43189 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF1O43189 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF1O43189 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF1O43189 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF1O43189 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF1O43189 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF1O43189 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF1O43189 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF1O43189 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF1O43189 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF1O43189 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF1O43189 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF1O43189 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF1O43189 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF1O43189 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF1O43189 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms