Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms