Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms