Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.2 ms