Protein–RNA interactions for Protein: O00408

PDE2A, cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2AO00408 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE2AO00408 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE2AO00408 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms