Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
O00370 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
O00370 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
O00370 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
O00370 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
O00370 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
O00370 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
O00370 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
O00370 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
O00370 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
O00370 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
O00370 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
O00370 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
O00370 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
O00370 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
O00370 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
O00370 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
O00370 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
O00370 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
O00370 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
O00370 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
O00370 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
O00370 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
O00370 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
O00370 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
O00370 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
O00370 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
O00370 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
O00370 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
O00370 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
O00370 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
O00370 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
O00370 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
O00370 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
O00370 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
O00370 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
O00370 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
O00370 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
O00370 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
O00370 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
O00370 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
O00370 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
O00370 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
O00370 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
O00370 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
O00370 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
O00370 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
O00370 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
O00370 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
O00370 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
O00370 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
O00370 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
O00370 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
O00370 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
O00370 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
O00370 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
O00370 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
O00370 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
O00370 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
O00370 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
O00370 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
O00370 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
O00370 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
O00370 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
O00370 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
O00370 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
O00370 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
O00370 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
O00370 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
O00370 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
O00370 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
O00370 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
O00370 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
O00370 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
O00370 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
O00370 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
O00370 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
O00370 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
O00370 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
O00370 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
O00370 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
O00370 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
O00370 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
O00370 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
O00370 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
O00370 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
O00370 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
O00370 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
O00370 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
O00370 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
O00370 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
O00370 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
O00370 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
O00370 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
O00370 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
O00370 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
O00370 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
O00370 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
O00370 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
O00370 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms