Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms