Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BQV1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BQV1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BQV1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BQV1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BQV1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BQV1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BQV1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
H3BQV1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
H3BQV1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
H3BQV1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
H3BQV1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
H3BQV1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BQV1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BQV1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BQV1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BQV1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BQV1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BQV1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BQV1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BQV1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BQV1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BQV1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BQV1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BQV1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BQV1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BQV1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BQV1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BQV1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BQV1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BQV1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BQV1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BQV1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BQV1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BQV1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BQV1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BQV1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BQV1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BQV1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BQV1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BQV1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3BQV1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3BQV1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3BQV1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
H3BQV1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3BQV1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3BQV1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3BQV1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3BQV1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3BQV1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3BQV1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3BQV1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3BQV1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3BQV1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3BQV1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3BQV1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BQV1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BQV1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BQV1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BQV1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BQV1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BQV1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BQV1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BQV1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BQV1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BQV1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BQV1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BQV1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BQV1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BQV1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BQV1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BQV1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BQV1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BQV1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BQV1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BQV1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BQV1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BQV1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BQV1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BQV1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BQV1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BQV1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BQV1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BQV1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BQV1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BQV1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BQV1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BQV1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BQV1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BQV1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BQV1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BQV1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BQV1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BQV1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BQV1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BQV1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BQV1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BQV1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BQV1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BQV1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms