Protein–RNA interactions for Protein: H3BQF6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQF6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3BQF6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3BQF6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3BQF6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3BQF6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3BQF6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3BQF6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3BQF6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3BQF6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3BQF6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3BQF6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3BQF6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3BQF6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
H3BQF6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3BQF6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3BQF6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3BQF6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3BQF6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3BQF6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
H3BQF6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3BQF6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3BQF6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3BQF6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3BQF6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
H3BQF6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3BQF6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3BQF6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3BQF6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H3BQF6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
H3BQF6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H3BQF6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
H3BQF6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H3BQF6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
H3BQF6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BQF6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BQF6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BQF6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BQF6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BQF6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BQF6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BQF6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BQF6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BQF6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BQF6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BQF6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BQF6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BQF6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BQF6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BQF6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BQF6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BQF6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BQF6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BQF6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3BQF6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3BQF6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
H3BQF6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3BQF6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3BQF6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3BQF6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3BQF6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3BQF6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3BQF6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3BQF6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3BQF6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3BQF6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3BQF6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BQF6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BQF6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BQF6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BQF6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BQF6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BQF6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BQF6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BQF6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BQF6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BQF6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BQF6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BQF6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BQF6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BQF6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BQF6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BQF6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BQF6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BQF6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BQF6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BQF6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BQF6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BQF6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BQF6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BQF6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BQF6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BQF6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BQF6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BQF6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BQF6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BQF6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BQF6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BQF6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BQF6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BQF6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms