Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
B4DGG1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
B4DGG1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
B4DGG1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
B4DGG1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
B4DGG1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
B4DGG1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
B4DGG1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
B4DGG1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DGG1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DGG1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DGG1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DGG1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DGG1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DGG1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DGG1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DGG1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DGG1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DGG1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DGG1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DGG1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DGG1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DGG1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DGG1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DGG1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DGG1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DGG1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DGG1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DGG1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DGG1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DGG1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DGG1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DGG1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DGG1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DGG1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DGG1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DGG1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DGG1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DGG1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DGG1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DGG1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DGG1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DGG1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DGG1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DGG1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DGG1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DGG1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DGG1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DGG1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DGG1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DGG1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DGG1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DGG1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DGG1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DGG1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DGG1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DGG1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DGG1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DGG1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DGG1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DGG1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DGG1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
B4DGG1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
B4DGG1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
B4DGG1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
B4DGG1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
B4DGG1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
B4DGG1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
B4DGG1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
B4DGG1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
B4DGG1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
B4DGG1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
B4DGG1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
B4DGG1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
B4DGG1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
B4DGG1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
B4DGG1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
B4DGG1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
B4DGG1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
B4DGG1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
B4DGG1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
B4DGG1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
B4DGG1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
B4DGG1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
B4DGG1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
B4DGG1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
B4DGG1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
B4DGG1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
B4DGG1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
B4DGG1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
B4DGG1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
B4DGG1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
B4DGG1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
B4DGG1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
B4DGG1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
B4DGG1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
B4DGG1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
B4DGG1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
B4DGG1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
B4DGG1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms