Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
B4DEV8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
B4DEV8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
B4DEV8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
B4DEV8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
B4DEV8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DEV8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DEV8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DEV8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DEV8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DEV8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DEV8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DEV8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DEV8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DEV8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DEV8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DEV8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DEV8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DEV8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DEV8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DEV8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DEV8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DEV8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DEV8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DEV8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DEV8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DEV8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DEV8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DEV8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DEV8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DEV8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DEV8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DEV8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DEV8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DEV8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DEV8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DEV8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DEV8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DEV8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DEV8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DEV8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DEV8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DEV8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DEV8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DEV8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DEV8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DEV8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DEV8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DEV8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DEV8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DEV8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DEV8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DEV8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DEV8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DEV8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DEV8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DEV8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DEV8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DEV8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DEV8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
B4DEV8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DEV8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DEV8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DEV8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DEV8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DEV8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DEV8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DEV8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DEV8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DEV8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DEV8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DEV8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DEV8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DEV8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DEV8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DEV8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DEV8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DEV8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DEV8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DEV8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DEV8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DEV8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DEV8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DEV8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DEV8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DEV8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DEV8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DEV8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DEV8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DEV8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DEV8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DEV8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DEV8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DEV8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DEV8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DEV8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DEV8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms