Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RGPD3A6NKT7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms