Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDR42E2A6NKP2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms