Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBY3A6NI87 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms