Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms