Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms