Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms