Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPDC1A2A3K4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms