Protein–RNA interactions for Protein: A0AV96

RBM47, RNA-binding protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM47A0AV96 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM47A0AV96 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM47A0AV96 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM47A0AV96 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM47A0AV96 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM47A0AV96 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM47A0AV96 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM47A0AV96 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM47A0AV96 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RBM47A0AV96 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RBM47A0AV96 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RBM47A0AV96 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM47A0AV96 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms