Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPC1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPC1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms