Protein–RNA interactions for Protein: V9GYH0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYH0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
V9GYH0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
V9GYH0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
V9GYH0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
V9GYH0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
V9GYH0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
V9GYH0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
V9GYH0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
V9GYH0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
V9GYH0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
V9GYH0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
V9GYH0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
V9GYH0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
V9GYH0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
V9GYH0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
V9GYH0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
V9GYH0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
V9GYH0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
V9GYH0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
V9GYH0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
V9GYH0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
V9GYH0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
V9GYH0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
V9GYH0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
V9GYH0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
V9GYH0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
V9GYH0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
V9GYH0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
V9GYH0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
V9GYH0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
V9GYH0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
V9GYH0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
V9GYH0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
V9GYH0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
V9GYH0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
V9GYH0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
V9GYH0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
V9GYH0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
V9GYH0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
V9GYH0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
V9GYH0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
V9GYH0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
V9GYH0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
V9GYH0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
V9GYH0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
V9GYH0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
V9GYH0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
V9GYH0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
V9GYH0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
V9GYH0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
V9GYH0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
V9GYH0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
V9GYH0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
V9GYH0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
V9GYH0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
V9GYH0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
V9GYH0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
V9GYH0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
V9GYH0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
V9GYH0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
V9GYH0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYH0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYH0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYH0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYH0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYH0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYH0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYH0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYH0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYH0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYH0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYH0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYH0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYH0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYH0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYH0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYH0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYH0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYH0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYH0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYH0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYH0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYH0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYH0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
V9GYH0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
V9GYH0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
V9GYH0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYH0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYH0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYH0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYH0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYH0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYH0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYH0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYH0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYH0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYH0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYH0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYH0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYH0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms