Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5A7

NUB1, NEDD8 ultimate buster 1, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUB1Q9Y5A7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUB1Q9Y5A7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUB1Q9Y5A7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms