Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms