Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms