Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF330Q9Y3S2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF330Q9Y3S2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF330Q9Y3S2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF330Q9Y3S2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF330Q9Y3S2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF330Q9Y3S2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF330Q9Y3S2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF330Q9Y3S2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF330Q9Y3S2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF330Q9Y3S2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms