Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZDHHC9Q9Y397 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms