Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN6Q9UQ52 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms