Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGTPBP1Q9UPW5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms