Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
L1RE1Q9UN81 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms