Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms