Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLEC4EQ9ULY5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLEC4EQ9ULY5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLEC4EQ9ULY5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLEC4EQ9ULY5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLEC4EQ9ULY5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLEC4EQ9ULY5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLEC4EQ9ULY5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms