Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC7AQ9ULT0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTC7AQ9ULT0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTC7AQ9ULT0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTC7AQ9ULT0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTC7AQ9ULT0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTC7AQ9ULT0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC7AQ9ULT0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC7AQ9ULT0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC7AQ9ULT0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC7AQ9ULT0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC7AQ9ULT0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms