Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB23Q9ULC3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB23Q9ULC3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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