Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CASP8AP2Q9UKL3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP8AP2Q9UKL3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms