Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms