Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNA3Q9UI47 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms