Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC3BQ9UH17 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms