Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT8Q9UFF9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms