Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CLN8Q9UBY8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms