Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFNKQ9P0W0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFNKQ9P0W0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFNKQ9P0W0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFNKQ9P0W0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFNKQ9P0W0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFNKQ9P0W0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFNKQ9P0W0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFNKQ9P0W0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFNKQ9P0W0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms