Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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SH3BP4Q9P0V3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
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SH3BP4Q9P0V3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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SH3BP4Q9P0V3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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SH3BP4Q9P0V3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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SH3BP4Q9P0V3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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SH3BP4Q9P0V3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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SH3BP4Q9P0V3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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SH3BP4Q9P0V3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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