Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PSD3Q9NYI0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSD3Q9NYI0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms