Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC5A4Q9NY91 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC5A4Q9NY91 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC5A4Q9NY91 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC5A4Q9NY91 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC5A4Q9NY91 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC5A4Q9NY91 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A4Q9NY91 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A4Q9NY91 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A4Q9NY91 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A4Q9NY91 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A4Q9NY91 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A4Q9NY91 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A4Q9NY91 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A4Q9NY91 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A4Q9NY91 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms