Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BARHL2Q9NY43 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms